墾丁高位珊瑚礁礁自然保留區位處恆春半島南端，墾丁國家公園境內。為保護此一特殊之高位珊瑚礁原始森林，於民國83年1月10日經行政院農業委員會公告成立之，屬林業試驗所管轄，並由林業試驗所恆春研究中心進行經營管理。海拔高200～300公尺，面積約137.6公頃，與恆春熱帶植物園主要展示區相接臨。
本區屬於潮濕季風林 (moist monsoon forest)，氣候乾濕季明顯。本區之平均降雨量約2,200 mm，多集中於6至11月，約佔全年雨量之85%，主要為梅雨季及颱風季之降雨所致；10月至翌年4月常有東北季風（俗稱落山風），為乾旱季節。保留區地質屬於更新世時代的石灰岩，由珊瑚、有孔蟲、石灰藻、貝殼所組成，根據碳十四定年法之測定，恆春半島每年約以2.5㎜ 的速度上升，在經過五十萬年左右，形成了現今的高位珊瑚礁 (Shi et al. 1988) 地形，土壤為石灰質性的中性或微酸性砂質壤土及輕黏土；土壤粘粒超過30%，起因於高溫多雨之環境，使得粘粒與游離鐵在剖面中明顯移動； pH值偏高，介於5.3～7.4之間(Hseu et al. 2004)。
自然資源現況：
本保留區是臺灣目前唯一保存最完整的高位珊瑚礁森林生態系，植物相經採集、整理，計有127科、538種維管束植物，以大戟科(Euphorbiaceae)、桑科(Moraceae)、 柿樹科(Ebenaceae)之木本植物為主。依國際自然保育聯盟 (IUCN) 的分類標準而言，本區的稀有植物有：
- 有滅絕危機種：象牙樹(Diospyros ferrea)、港口馬兜鈴(Aristolochia zollingerianna)、毛柿(Diospyros discolor)等。
- 稀有種：中華雙蓋蕨(Allantodia dilatata)、琉球蛇菰(Balanophora fungosa)、柿葉茶茱萸(Gonocaryum calleryanum)、恆春皂莢(Gleditsia rolfei)、錫蘭七指蕨(Helminthostachys zeylanica)等。
在植物群落方面，恆春半島的植被包含熱帶海岸林及熱帶季風林之群系，蘇鴻傑等於研究墾丁國家公園植被時，將此區植群歸類為黃心柿 (Diospyros maritima) —白榕 (Ficus benjamina var. bracteaba) 亞型，其組成除白榕及其他榕樹類以外，另有大量的珊瑚礁岩生植物，如黃心柿、鐵色 (Drypetes littoralis)、象牙樹、毛柿 、紅柴 (Aglaia formosana)、大葉山欖 (Palaquium formosanum)等。受季節風之影響，生長在珊瑚礁岩塊頂部的樹木呈低矮匍匐狀；相對的，在岩塊間窪地生長的樹木呈高大直立狀。
保留區內哺乳類動物種類有臺灣獼猴、白鼻心、刺鼠、赤腹松鼠、鼬獾、梅花鹿、臺灣野豬等，以及翼手目包括有摺翅蝠 (Miniopterus schreibersi)、臺灣小蹄鼻蝠 (Rhinolophus monoceros)、大蹄鼻蝠 (Rhinolophus luctus formosae)、臺灣葉鼻蝠 (Hipposideros terasensis)、無尾葉鼻蝠 (Coelops frithi)、臺灣鼠耳蝠 (Myotis taiwanensis)、 臺灣管鼻蝠 (Murina puta)、和棕蝠 (Eptesicus serotinus)等八種，前4種出現頻度較高；其中梅花鹿為墾丁國家公園管理處野放之族群。鳥類經調查結果有20科 (含亞科)、32種，常見鳥類有紅嘴黑鵯(Hypsipetes madagascariensis)、繡眼畫眉 (Alcippe morrisonia)、五色鳥 (Megalaima oorti)、烏頭翁 (Pycnonotus taivanus)、小彎嘴畫眉 (Pomatorhinus ruficollis)、和黑枕藍鶲 (Hypothymis azurea) 可稱為此區域之6種優勢鳥種，其中前4種更為常見。
板塊運動推升隆起的珊瑚礁是墾丁高位珊瑚礁自然保留區的主要地質，土壤層淺薄，但是植物仍然茂密生長。
白榕是本區森林優勢物種之一，植物形態仿若爬行動物，跨生於珊瑚礁岩上。
墾丁高位珊瑚礁森林森林冠層