細葉山茶(Camellia brevistyla)是臺灣原生樹種，種籽可以生產食用油，具有重要的經濟價值。 本研究我們建立了細葉山茶的轉錄組(transcriptome)分析資料庫，並且初步測試可用的簡單重複序列 (simple sequence repeat, SSR)引子。轉錄組定序，組裝後得到65,722個重組序列(unigene)，並且在 47,595個重組序列中找到25,996個簡單重複序列，並且設計出8,113組聚合酶鏈鎖反應的引子對，其 中簡單重複序列長度大於18 bp的有2,158組，以三核甘酸(tri-nucleotide)的重複形式，以及CT/TC重複 (37%)出現最多次。實際測試90組簡單重複序列中，有49組可以成功得到擴增產物(amplicon)，成功率 為54.44%。轉錄組資料庫分析中，有34,009個重組序列被註解並取得到基因本體(gene ontology, GO) 分析資料，在KEGG分析資料中，總共有7,842個重組序列分析取得16,109關於代謝途徑的酵素反應位 置，其中和脂肪酸代謝途徑相關的有23個酵素反應位置。本研究建立了臺灣原生細葉山茶的轉錄體資 料庫，並發現多組簡單重複序列引子，預期將有助於日後細葉山茶的分子育種、品種鑑定、基因選殖 與遺傳分析。