植物病原真菌Fusarium oxysporum f. sp. koae被認為是造成臺灣相思樹苗木及樹木萎凋病的原因
之一。由於植物的健康被認為與土壤中的微生物族群密切相關，且F. oxysporum為重要的土壤傳播性
病原菌之一，因此本研究嘗試分析健康與罹病植株的根圈土壤微生物相之差異性。我們採集相思樹
造林地內健康和萎凋相思樹的根圈土壤，萃取土壤核酸並以次世代定序 (next generation sequencing,
NGS) 技術，針對樣本中的真菌轉錄區間 (internal transcribed spacer, ITS) 和細菌16S核糖體DNA (16S
ribosomal DNA, 16S rDNA) 進行定序與菌相分析。結果顯示健康與萎凋相思樹根圈土壤的真菌和細菌
組成，在綱和屬的分類階層均沒有顯著的差異，且Fusarium屬真菌並非主要存在的微生物族群。雖然
健康相思樹立地環境土壤中的真菌和細菌多樣性高於萎凋相思樹的土壤，但兩者間亦沒有顯著差異。
線性判別分析 (Linear Discriminant Analysis, LDA) 發現，萎凋相思樹土壤樣本中顯著較多的微生物
類群有：真菌Cephalotrichum屬；細菌Gammaproteobacteria和Proteobacteria門，Rhodanobacteraceae
目，Kapabacteriales、Diplorickettsiales和Xanthomonadales科，Lacunisphaera和Chujaibacter屬。本研
究首次對國內相思樹造林地的土壤微生物相進行分析，將有助於未來釐清與造林地相思樹萎凋有關的
生物性因子並提供植物與微生物間交互作用研究之參考。