蓮華池研究中心「生態教育館」是一座多功能生態教育場所，包括視聽教室、會議室、研討室、圖書室、展示室、志工值勤室及學員宿舍等諸多功能，藉以強化生態解說及教育功能，讓參訪學員能更加親近及瞭解森林，同時也維持並提供良好之研究環境，提供食、宿及網路等服務，以方便連續性研究及夜間觀察活動，並配合各機關團體及學校實施戶外參訪與教學。
「生態教育館」位於本中心行政區北側，係一棟三層樓ㄇ字型建物，自民國93年起分年編列經費進行主體建物新建暨內部裝修等工程，迄民國96年12月全部完工並落成啟用；一樓設置階梯式視聽教室(包括電腦、單槍投影機、DVD撥放器及廣播系統等視聽設備)，二樓為會議室(包括電腦、單槍投影機及廣播設備)、小型研討室、圖書室及學員宿舍，三樓為展示室、志工值勤室及學員宿舍。