本所樹木醫學研究中心的功能在於整合樹木保護與醫療的研究和技術資源，提供都市樹木健康管理、診斷與醫療等服務，創造適合都市樹木、森林健全發展的環境。目前，樹木醫學中心之下已有先前個別計畫所建置的「林木疫情鑑定與資訊中心」、「樹木褐根病調查通報系統」及「筆筒樹疫情監測資訊網」等網站系統；同時，隨著樹木醫學中心研究與服務業務的擴增，所累積的資料內容亦趨龐大、複雜，而必須進行資訊彙整。考量都市樹木等綠色基礎建設整體的維護、發展與管理，與都市樹木保護之關係不可分割，也亟需建立都市樹木生長健康與環境適宜性長期監測之架構與方法，並納入整合資訊系統中。本組生態資訊研究團隊長期與國際生態和生物多樣性資訊研究的學術單位、國際組織進行交流合作，致力於將生態資訊管理之技術應用於都市樹木保護整合資訊系統之研發與建置，做為本所樹木醫學中心技術與資源整合之基礎。
樹木保護資訊系統的研究與開發